【マスターボールのプロトタイプ作成へ】
マサキから連絡がありグレン島のポケモン研究所へ。
さっきまで命の取り合いしてた相手によくすぐ連絡してくるなコイツ。
フジ老人とマサキとカツラがいました。
シルフカンパニーから入手した図面やらで、自分たちでマスターボールのプロトタイプを作ろうとしている？
→どうもミュウツー側なのか、ボール側の欠陥なのか、ミュウツーは捕まえられないとのこと。
とりあえず何を捕まえるかは教えて貰えず。まずはなんか頼み事だけされる。
①トキワの森にジョウト地方のぼんぐりのみを植えたからとってきて。
②タマムシシティにあるシルフカンパニーのデータ？ロケット団のアジトにあるのか。
コレは確かに俺にしか出来ないか。
んー？なんだろ？
ミュウツー以上の伝説のポケモンを捕まえようとしてるのか……？
とりあえずマサキの言う通りミッションこなしていきますか。
まずはトキワの森。これか。誰かいるな。
お。シルバーじゃん！ボスの息子。
なんかウダウダロケット団について喋って帰って行きました。口ぶり的にもうロケット団はレッドにやられちゃった後かな？？
あ。ロケット団の連絡が入った。
なんかタマムシシティに戻らなきゃだ。……ってことは。。。
【シルフカンパニーから撤退】
タマムシシティのアジトに戻ります。
あー、ボスも幹部もいる。シルフカンパニーにいたはずの彼らがここにいるということは、もう負けた後か。
ボス、ブチギレてる。
そしてあのレッドにカードキー取られちゃう事件の犯人はやっぱりコイツがやらかしたのか（笑）めちゃ怒られてる。
ニドキングで攻撃されて、彼はロケット団をクビになりました（笑）まぁ、予想通りですね。やらかしすぎです。
ロケット団はここで最後のジムバッジに備えてトキワジムに集合することに。幹部も連絡あり次第トキワジムに行くらしい。
そこでレッドとの総決戦か！！
アジトは誰もいなくなりマサキからのミッション回収！
のところで火事場泥棒がいたので排除。
キュウコン、ドククラゲ、ブーバー、ペルシアンなどなど、なかなか強いやつ繰り出してくる。
ただし倒せば盗める。そう、昇進したからね！！とりあえずブーバーにしときますか。
さて２つのアイテムを手に入れたのでマサキの元に向かいますか！！
これでマスターボールのプロトタイプが完成。
ってところで、和名のシゲキってやつを探すことに？？
結局シゲキって誰なの？笑
ミュウツーに組み込まれているDNAが5人の科学者を使っているため、ミュウツーならシゲキの居場所がわかるらしい。
おん？
このマスターボールでは捕まえられないけど、ミュウツーに「捕まえるぞ！」と脅してでもシゲキの居場所を聞けって？
え。このマスターボールいらないじゃん（笑）
とりあえずハナダの洞窟へ。
これ「チャンピオンしか入れない」って門番がいるから入れないのよ。
どうすんの？……と思ったところ、この門番ともバトル！？
すげーな、この作品（笑）
まぁこちらは悪役ですからね。押し通ります！！
カイロス、アーボック、ウィンディ、パラセクト。
とりあえずウィンディを盗む。
お。ミュウツーさんいた。
そして普通に喋れて意思疎通ができる。
やなり戦うことになるのか。って、レベル70！？
本編そのままじゃん！？捕まえられないんだよね？
マジか。
俺の手持ち、シルフカンパニーで爆上げさせたニョロボンでさえレベル50なんだけど。
悪技はニョロボンに前に覚えさせた「どろぼう」のみ。
ダメだ。リフレクトでバリアを張られるため微々たるダメージ。
ただニョロボンには「かわらわり」もあるので、それを破壊するとまたバリアを掛け直したり、「ド忘れ」で特防上げたりと攻撃以外の行動してくれる。
その隙に「どろぼう」と「かわらわり」で削って行きます！！
倒したー！攻撃技してこないのかな？それとも「かわらわり」で割ってたおかげで他の技使いがちだった？？
シゲキの居場所を教えてもらう。
シゲキとは誰なんだ。どこにいるんだ……！？
ってトキワシティのモブ！？嘘でしょ？笑
どうやら、やっぱりメタモンとミュウツーの間の失敗作がいるみたいです。
そいつの居場所をシゲキが知ってて、それをこのマスターボールで捕まえるってことかな？？
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